Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms