Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp444Q3TDV8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp444Q3TDV8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms