Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Treml4Q3LRV9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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