Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3KNL4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms