Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam178bQ24JP3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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