Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Samd11Q1RNF8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Samd11Q1RNF8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd11Q1RNF8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Samd11Q1RNF8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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