Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Lingo4Q149C3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Lingo4Q149C3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Lingo4Q149C3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Lingo4Q149C3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Lingo4Q149C3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Lingo4Q149C3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Lingo4Q149C3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Lingo4Q149C3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms