Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf3ip1Q149C2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms