Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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