Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmntd2Q0VET5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms