Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps8Q0P5W1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps8Q0P5W1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms