Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssrp1Q08943 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms