Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxc4Q08624 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc4Q08624 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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