Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnma1Q08460 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms