Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cnn2Q08093 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cnn2Q08093 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnn2Q08093 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cnn2Q08093 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnn2Q08093 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms