Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn1Q08091 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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