Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a2Q07643 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms