Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col17a1Q07563 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms