Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AmbpQ07456 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AmbpQ07456 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AmbpQ07456 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AmbpQ07456 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AmbpQ07456 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AmbpQ07456 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms