Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdf3Q07104 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms