Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPINDOCQ05AH6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPINDOCQ05AH6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPINDOCQ05AH6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms