Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mex3cQ05A36 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mex3cQ05A36 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms