Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms