Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpd1Q04519 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms