Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms