Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms