Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms