Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp11Q02853 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp11Q02853 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp11Q02853 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms