Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax5Q02650 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax5Q02650 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms