Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snai1Q02085 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snai1Q02085 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snai1Q02085 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snai1Q02085 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snai1Q02085 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snai1Q02085 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snai1Q02085 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai1Q02085 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms