Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VcpQ01853 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms