Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms