Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top2aQ01320 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Top2aQ01320 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms