Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pde1bQ01065 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms