Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms