Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms