Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms