Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Il6stQ00560 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Il6stQ00560 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms