Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms