Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp10Q000W5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp10Q000W5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms