Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VldlrP98156 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VldlrP98156 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VldlrP98156 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms