Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlkP97793 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlkP97793 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlkP97793 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlkP97793 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlkP97793 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlkP97793 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlkP97793 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlkP97793 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlkP97793 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlkP97793 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlkP97793 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AlkP97793 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AlkP97793 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AlkP97793 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AlkP97793 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AlkP97793 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AlkP97793 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlkP97793 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlkP97793 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms