Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nbr1P97432 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms