Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lig3P97386 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig3P97386 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms