Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Taf1bP97358 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf1bP97358 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms