Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

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Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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