Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms