Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr4P70658 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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