Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp9xP70398 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp9xP70398 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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