Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms